底质恶化的主要因素
养殖水深与增氧能力脱节造成底层溶氧不足，底泥发臭。水深1.5米以上的池塘仅有水车式增氧机，池塘底层溶氧会经常不足，有机物在厌氧状态下分解增加了氨氮、亚**盐的释放量。
增氧机安装位置不当，未能与池壁形成合理的角度，导致大量有机物被带到池边死角，久了容易发臭。
砂质池塘因砂质颗粒较大，吸附氨等有害物质的能力较差，易发臭。
改善底质的基本策略和方法
化学方法
化学方法主要有清塘时候使用生石灰，根据生石灰遇水后发生化学反应, 放出大量的热能，中和淤泥中的各种有机酸，改变酸性环境，从而可以起到除害杀菌、施肥、改善底质和水质的作用，此方法是养殖准备期进行，方法简单，运用较广。
以CaO2为主的化学改良剂目前是化学改底中常见的一种，该类物质主要是对池塘进行碱化，提高池塘酸碱度，同时增氧底部溶氧，促进硝化作用进度，降低氨氮、亚盐等含量，降低池塘有害物质含量；目前市场上兴起的螯合剂也是一种化学改良剂，能直接将氨氮，亚盐等离子进行螯合，形成螯合产物。
不良底质
、“泥皮”底质
形成原因：大量老化死亡藻类和悬浮胶体沉积物沉淀于底部，在微生物作用后，会变成浮皮、并在水体表面形成大量泡沫等。
“丝藻”底质
形成原因：底质与水体之间营养元素的交换被阻隔，致使水体营养元素的不平衡或缺乏，出现“倒藻”、“转水”（水质一夜之间变清），水质过瘦，清澈见底，底部丝状藻、青泥苔大量繁殖。